Sim, mas com ressalvas importantes.
Do ponto de vista científico, pesquisas para cargos legislativos têm uma base mais frágil do que para cargos majoritários (presidente, governador e prefeito).
Isso ocorre porque:
O número de candidatos é muito maior, o que dificulta obter uma amostra suficiente para estimar a intenção de voto de cada um com precisão.
Muitos eleitores decidem seu voto para deputado apenas nas últimas semanas da campanha.
Há um elevado percentual de indecisos e de mudanças de voto.
Como os votos ficam muito pulverizados entre centenas de candidatos, a margem de erro para cada candidato individual costuma ser bastante alta.
Por isso, estatísticos e cientistas políticos consideram que pesquisas para o Legislativo podem identificar tendências gerais, candidatos mais conhecidos ou grupos competitivos, mas têm menor capacidade preditiva do que pesquisas para cargos majoritários.
Em resumo, existe base científica para realizá-las, desde que a metodologia seja adequada e as limitações sejam reconhecidas. Entretanto, a precisão dessas pesquisas é naturalmente menor, especialmente em eleições proporcionais com muitos candidatos e baixa definição do eleitorado. Informações IA.

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